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Mackenzie R. Neal
Paul D. McNicholas
Arthur White

龟壳聚类:面向判别式聚类的混合方法及其在流式细胞术等数据中的应用

研究问题
摘要称,研究如何融合生成式聚类(刻画簇的几何性质)与判别式聚类(刻画簇间边界)的优点,构造一种完全无监督、概率化且具判别性的聚类方法。
方法与思路
作者提出以正则化互信息为目标函数,用高斯分布与均匀分布的混合之混合来构建条件模型;通过引入正则项与簇合并步骤避免过拟合,思路类似贝叶斯聚类中的可逆跳马尔可夫链蒙特卡洛做法。
材料陈述的贡献
摘要称由此得到“龟壳法”:完全无监督,能估计非线性边界、自动选择成分数,并在噪声或不规则簇形状等数据异常下捕捉直观的簇;在模拟与真实数据、流式细胞术和图像分析数据上做了测试。
阅读关注点
应核对正则化互信息目标的具体形式与优化算法、混合之混合条件模型的识别与可解释性、簇合并与成分数选择的判定准则,以及模拟和流式细胞术、图像数据上的评价指标与对比基准。
阅读边界
仅凭摘要无法判断方法的理论保证、识别条件、超参数敏感性、计算成本与相对既有方法的实际优劣;摘要未说明具体数据规模、数值结果与实现细节。该文为 arXiv 预印本,未经同行评审验证。

原文摘要

Generative approaches to clustering provide information on geometric properties of clusters, whereas discriminative approaches provide boundaries between clusters. Ideas from both approaches are incorporated to present a fully unsupervised, probabilistic, and discriminative clustering method via a regularized mutual information objective function, wherein a mixture of mixtures of Gaussian and uniform distributions is used for formulation of the conditional model. Overfitting is avoided by the introduction of a regularizing term and a cluster merge step, similar to those applied in reversible jump Markov chain Monte Carlo methods used in Bayesian clustering. Consequently, the turtle shell method -- a fully unsupervised clustering method capable of estimating non-linear boundary lines, automatically selecting the number of components, and capturing intuitive clusters in the presence of data abnormalities such as noise and/or irregular cluster shapes -- is introduced. We test this method on various simulated and real datasets commonly explored in clustering research, and extend the analysis to datasets arising from flow cytometry experiments and image analysis.

笔记与分组
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