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Sergio Bacallado
Stefano Favaro
Lorenzo Trippa

可逆马尔可夫链的贝叶斯非参数分析

研究问题
面对由未知转移核的可逆马尔可夫链生成的数据,如何构造非参数先验,并用于存在序列依赖的物种抽样问题?
方法与思路
作者提出三参数强化随机游走方案,将边强化游走推广到不可数空间,并借助马尔可夫链的 de Finetti 定理定义先验。
材料陈述的贡献
摘要称,该方案连接边强化游走与双参数 Hoppe urn 方案,参数可调节访问状态数量,并用于蛋白质折叠模拟数据分析。
阅读关注点
应核对强化规则、参数范围与可逆性保证、先验对应的转移核,以及后验计算如何处理序列依赖和新状态。
阅读边界
仅据 OpenAlex 索引摘要,稿件版本未注明;后验一致性、计算成本及应用结果未说明,不能推断适用于非可逆马尔可夫链。

原文摘要

We introduce a three-parameter random walk with reinforcement, called the $(\theta,\alpha,\beta)$ scheme, which generalizes the linearly edge reinforced random walk to uncountable spaces. The parameter $\beta$ smoothly tunes the $(\theta,\alpha,\beta)$ scheme between this edge reinforced random walk and the classical exchangeable two-parameter Hoppe urn scheme, while the parameters $\alpha$ and $\theta$ modulate how many states are typically visited. Resorting to de Finetti’s theorem for Markov chains, we use the $(\theta,\alpha,\beta)$ scheme to define a nonparametric prior for Bayesian analysis of reversible Markov chains. The prior is applied in Bayesian nonparametric inference for species sampling problems with data generated from a reversible Markov chain with an unknown transition kernel. As a real example, we analyze data from molecular dynamics simulations of protein folding.

笔记与分组
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