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分类依据与纠错

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关注这篇论文的作者
Bret Larget
Donald L. Simon
Joseph B. Kadane

基于动物线粒体基因组排列的贝叶斯系统发育推断

研究问题
如何利用线粒体基因组的排列信息推断远缘动物类群的进化关系,并将这类信息用于八个动物门之间的关系评估?
方法与思路
作者建立基于线粒体基因组排列数据的贝叶斯系统发育推断框架,通过马尔可夫链蒙特卡洛方法进行计算并开展应用。
材料陈述的贡献
摘要称,研究提供了利用基因组排列推断进化关系的贝叶斯框架,并将其应用于八个动物门;未报告具体关系结论。
阅读关注点
应核对基因组排列的演化模型、树与模型参数的先验、采样算法的收敛诊断,以及八个动物门的后验关系和不确定性。
阅读边界
仅据所给 Crossref 摘要,不能判断系统发育结论的可靠性;排列数据可能更有信息的陈述不等于已验证其普遍优于序列数据。

原文摘要

Summary The determination of evolutionary relationships is a fundamental problem in evolutionary biology. Genome arrangement data are potentially more informative than deoxyribonucleic acid sequence data for inferring evolutionary relationships between distantly related taxa. We describe a Bayesian framework for phylogenetic inference from mitochondrial genome arrangement data using Markov chain Monte Carlo methods. We apply the method to assess evolutionary relationships between eight animal phyla.

笔记与分组