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Alexander Hägele
Jonas Rothfuss
Lars Lorch
Andreas Krause

BaCaDI:干预目标未知时的贝叶斯因果发现

研究问题
当实验数据来自多个干预条件,但干预目标未知或不确定且样本有限时,如何联合推断因果结构与干预作用位置?
方法与思路
作者提出可微的贝叶斯框架 BaCaDI,利用基于梯度的变分推断,近似干预目标和因果结构的复杂联合后验分布。
材料陈述的贡献
摘要称,在合成因果发现任务和模拟基因表达数据中,BaCaDI 识别因果结构及干预目标的表现优于所比较的相关方法。
阅读关注点
应核对干预类型与目标的建模限制、联合后验的先验设定,以及变分近似是否充分表达结构不确定性和多种解释。
阅读边界
这是 arXiv 预印本,不能据此认定已通过同行评审或获期刊接收;摘要未说明可识别条件,实验依据仅涉及合成及模拟数据。

原文摘要

Inferring causal structures from experimentation is a central task in many domains. For example, in biology, recent advances allow us to obtain single-cell expression data under multiple interventions such as drugs or gene knockouts. However, the targets of the interventions are often uncertain or unknown and the number of observations limited. As a result, standard causal discovery methods can no longer be reliably used. To fill this gap, we propose a Bayesian framework (BaCaDI) for discovering and reasoning about the causal structure that underlies data generated under various unknown experimental or interventional conditions. BaCaDI is fully differentiable, which allows us to infer the complex joint posterior over the intervention targets and the causal structure via efficient gradient-based variational inference. In experiments on synthetic causal discovery tasks and simulated gene-expression data, BaCaDI outperforms related methods in identifying causal structures and intervention targets.

笔记与分组
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