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分类依据与纠错

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代码、数据与补充材料

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Leying Guan

含辅助协变量的平滑概率 PARAFAC 模型

研究问题
对于高维、稀疏且采样时间不规则的矩阵值纵向数据,如何提取受试者低维表示,并研究该表示与静态临床协变量的关系?
方法与思路
作者提出含协变量的平滑概率 PARAFAC 模型 SPACO,将平滑与概率化的分解框架结合,并纳入感兴趣的辅助协变量。
材料陈述的贡献
摘要称,该方法针对高维特征和稀疏不规则时间采样开展建模,通过多方面模拟及新冠感染患者免疫数据展示用途。
阅读关注点
应核对张量分解与平滑结构、低维表示的可识别性、缺失和不规则采样的处理,以及协变量关系的评价方式。
阅读边界
这是 arXiv 预印本,同行评审或期刊接收未核实;摘要未说明具体模型约束、理论性质与数值结果,不能判断比较优势。

原文摘要

In immunological and clinical studies, matrix-valued time-series data clustering is increasingly popular. Researchers are interested in finding low-dimensional embedding of subjects based on potentially high-dimensional longitudinal features and investigating relationships between static clinical covariates and the embedding. These studies are often challenging due to high dimensionality, as well as the sparse and irregular nature of sample collection along the time dimension. We propose a smoothed probabilistic PARAFAC model with covariates (SPACO) to tackle these two problems while utilizing auxiliary covariates of interest. We provide intensive simulations to test different aspects of SPACO and demonstrate its use on an immunological data set from patients with SARs-CoV-2 infection.

笔记与分组