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Jacopo Di Iorio
Marzia A. Cremona

funBIalign:基于均方残差评分的函数型模式发现层次算法

研究问题
如何在单条曲线的不同片段或多条未对齐曲线中,发现反复出现的典型形状,并评价这些函数型模式的相似性?
方法与思路
作者用加性模型定义函数型模式,结合完全链接凝聚层次聚类和基于均方残差评分的函数距离,构造多步骤发现算法。
材料陈述的贡献
摘要称,funBIalign可发现单曲线和多曲线中的重复模式,并通过模拟比较及食品价格通胀、温度变化案例展示用途。
阅读关注点
应核对加性模式定义允许哪些形状变化、片段对齐与聚类阈值如何选择,以及模拟比较的评价指标和计算成本。
阅读边界
这是arXiv预印本,同行评审或接收未核实;摘要未提供统计保证或具体比较结果,不能将模式发现直接解释为经济机制。

原文摘要

Motif discovery is gaining increasing attention in the domain of functional data analysis. Functional motifs are typical "shapes" or "patterns" that recur multiple times in different portions of a single curve and/or in misaligned portions of multiple curves. In this paper, we define functional motifs using an additive model and we propose funBIalign for their discovery and evaluation. Inspired by clustering and biclustering techniques, funBIalign is a multi-step procedure which uses agglomerative hierarchical clustering with complete linkage and a functional distance based on mean squared residue scores to discover functional motifs, both in a single curve (e.g., time series) and in a set of curves. We assess its performance and compare it to other recent methods through extensive simulations. Moreover, we use funBIalign for discovering motifs in two real-data case studies; one on food price inflation and one on temperature changes.

笔记与分组
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