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Prayag Chatha
Yixin Wang
Zhenke Wu
Jeffrey Regier

用于电子健康记录因果推断的动态生存 Transformer

研究问题
如何利用电子健康记录中的时变信息刻画患者生存概率,并估计治疗干预对限制平均生存时间的因果效应?
方法与思路
作者提出动态生存 Transformer,纳入随时间变化的患者信息,并使用源自 MIMIC-III 的半合成数据评估预测与因果估计。
材料陈述的贡献
摘要称 DynST 能预测随时间演化的生存概率,并在所用半合成数据上获得比两个替代模型更好的预测及治疗效应估计表现。
阅读关注点
应核对治疗干预与因果目标的定义、时变信息的使用顺序、删失处理,以及半合成数据生成机制和比较模型的设定。
阅读边界
这是 arXiv 预印本,不能据此认定已同行评审或期刊接收;摘要未说明因果识别条件,半合成结果不能直接证明真实临床有效性。

原文摘要

In medicine, researchers often seek to infer the effects of a given treatment on patients' outcomes. However, the standard methods for causal survival analysis make simplistic assumptions about the data-generating process and cannot capture complex interactions among patient covariates. We introduce the Dynamic Survival Transformer (DynST), a deep survival model that trains on electronic health records (EHRs). Unlike previous transformers used in survival analysis, DynST can make use of time-varying information to predict evolving survival probabilities. We derive a semi-synthetic EHR dataset from MIMIC-III to show that DynST can accurately estimate the causal effect of a treatment intervention on restricted mean survival time (RMST). We demonstrate that DynST achieves better predictive and causal estimation than two alternative models.

笔记与分组
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